Alors bon je suis blonde, et je ne trouve pas le petit "tic" vert pour que le topic soit considéré comme résolu... C'est pas parce que je n'étais pas inscrite jusqu'à maintenant ?

J'ai cette regexp là pour le start AUG et le stop UAG ou UGA ou UAA : '/AUG(?:[ACGU]{3}(?<!U(?:AG|GA|AA)))+U(?:AG|GA|AA)/u'
Par contre si le stop peut être : UGA ou AGA ou AGG que devient " !U(?:AG|GA|AA)))+U(?:AG|GA|AA) " ?

et ma dernière question : Comment puis-je obtenir la longueur de tous les orfs ? (La longueur de chacun des orfs additionnée)
Je sais que pour avoir la longueur d'une chaîne la fonction c'est strlen($chaine) mais si je fais strlen($value) je n'ai que la longueur du premier orf...

Exemple :

Code : Tout sélectionner

foreach ($tableau[0] as &$value) { echo "$value"; }

La si je mets ensuite strlen($value) il va correspondre qu'a la longueur d'un seul orf non ?

$compteur = 0;
foreach ($tableau[0] as &$value)
{
$compteur += strlen($value);
}

echo $compteur;

echo array_sum(array_map('strlen', $tableau[0]));

J'ai oublié le "?"... Ca vient pas du $tableau(0) ? lol (Je mets pas des parenthèses dans mon code mais j'ai un mac donc je ne les ai pas sur mon clavier lol)

CCCAUGGGGGGGGGGUAGCCCAUGAAAAAAAAAUGACCCAUGGGGGGGUAACCC

Voilà normalement tu obtiens 3 séquences et aucun C.

$arn = 'CCCAUGGGGGGGGGGUAGCCCAUGAAAAAAAAAUGACCCAUGGGGGGGUAACCC';
preg_match_all('/AUG(?:[ACGU]{3}(?<!U(?:AG|GA|AA)))+U(?:AG|GA|AA)/u', $arn, $tableau);
foreach ($tableau[0] as $value)
{
    $orf = chunk_split($value, 3, ' ');
    echo "<br/><br/><div id='orf'><h1>ORF : </h1>ORF obtenus : $orf<br/><br/>";
}