Sauf que wamp ou xampp installe du PHP5...
Donc déjà règles problèmes de short_tags : remplacer <? par <?php
Cela règlera ton problème de menu, car actuellement le code PHP doit être affiché en brut dans le code HTML selon moi.

<?
if (!isset($_GET['page'])|| $_GET['page'] == "")
{
include("pages/accueil.php");
}
else if($_GET['page'] == "accueil"){
	$page="pages/accueil.php";
	include $page ;
}
else if($_GET['page'] == "import"){
	$page="pages/import.php";
	include $page ;
}
else if($_GET['page'] == "presentation"){
	$page="pages/presentation.php";
	include $page ;
}
else if($_GET['page'] == "actualites"){
	$page="pages/actualites.php";
	include $page ;
}
else if($_GET['page'] == "gestion_repertoire"){
	$page="pages/gestion_repertoire.php";
	include $page ;
}
else if($_GET['page'] == "action"){
	$page="pages/action.php";
	include $page ;
}
else if($_GET['page'] == "contactez-nous"){
	$page="pages/contactez-nous.php";
	include $page ;
}

<td height="26" background="images/transit_43.gif">
				<span class="menu"><strong>&nbsp;<img src="images/logo.png" width="20" height="13">&nbsp;&nbsp;&nbsp;<a href="?page=gestion_repertoire">Gestion du r&eacute;pertoire</a></strong></span>
			</td>

session_start();
# CONFIGURATION
$CONFIG['host'] = "localhost";
$CONFIG['name'] = "transit";
$CONFIG['user'] = "root";
$CONFIG['pass'] = "";
# IDENTIFICATION
$connection = null;
$result = null;
$user = null;
$password = null;
$login = null;

Sans plus d'informations sur le système il va être difficile de te répondre.
Les erreurs PHP sont-elles activées sur ton nouvel environnement dans le php.ini ?