Je pense que ton soucis vient de la présence du domaine dans ta règle, du coup au lieu d'un rewrite il fait peut être une redirection... si tu essaies comme ceci, est-ce que ça fonctionne mieux :

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RewriteRule ^S([0-9]+)$ V5.5/visit/visit.php?chx=soc&idc=$1 [L]

Le principe de l'url rewriting, c'est justement cela : l'utilisateur renseigne une url et le serveur fait appel à un script de façon totalement transparente, ce n'est pas une redirection. Tu n'as donc pas à chercher "comment afficher l'url demandée" puisque cela va se faire simplement en cliquant sur un lien, mais plutôt comment faire pour que cette url exécute bien ton script

Ce qui me semble bizarre, c'est que ton masque (^S([0-9]+)\.fb$) ne correspond pas à ton exemple (S3101) .. y a pas de ".fb" à la fin de ton url

En quoi tu as des milliers de rewrite... On peut toujours faire un motif qui englobe toutes les possibilités.