// Variable de stockage des fichiers et codes secrets associés
$CODES = array(
				1 => array('nom_du_fichier_1', 'code_secret_1');
				2 => array('nom_du_fichier_2', 'code_secret_2');
				3 => array('nom_du_fichier_3', 'code_secret_3');
				...
				51 => array('nom_du_fichier_51', 'code_secret_51');
				52 => array('nom_du_fichier_52', 'code_secret_52');
			);


// URL de la page type http://www.monsite.com/page.php?code=XXXXX
if(isset($_GET['code']))
{
	// Boucle sur la variable $CODES
	for($i=1 ; $i<=52 ; $i++)
	{
		// Si le code de l'URL correspond au code de la variable, on affiche le lien
		if($CODES[$i][1] == $_GET['code'])
		{
			echo "<a href='Repertoire_source/".$CODES[$i][0]."'>".$CODES[$i][0]."</a>";

			// Et on arrête la boucle
			break;
		}
	}
}

// Variable de stockage des fichiers et codes secrets associés
$CODES = array(
				1 => array('nom_du_fichier_1', 'code_secret_1');
				2 => array('nom_du_fichier_2', 'code_secret_2');
				3 => array('nom_du_fichier_3', 'code_secret_3');
				...
				51 => array('nom_du_fichier_51', 'code_secret_51');
				52 => array('nom_du_fichier_52', 'code_secret_52');
			);


// URL de la page type http://www.monsite.com/page.php?code=XXXXX
if(isset($_GET['code']))
{
	// Boucle sur la variable $CODES
	for($i=1 ; $i<=52 ; $i++)
	{
		// Si le code de l'URL correspond au code de la variable,
		// ET si la semaine actuelle correspond, on affiche le lien
		if($CODES[$i][1] == $_GET['code'] && date(W) == $i)
		{
			echo "<a href='Repertoire_source/".$CODES[$i][0]."'>".$CODES[$i][0]."</a>";

			// Et on arrête la boucle
			break;
		}
	}
}

<a href='ici_lien_de_telechargement' download='nom_sous_lequel_le_fichier_sera_téléchargé'>...</a>

J'ai oublié une parenthèse : $semaine = intval(substr($_FICHIERS[$i], -6, 2));

<?php

$_FICHIERS = scandir("./Repertoire_source");
for($i=0 ; $i<sizeof($_FICHIERS) ; $i++)
{
	// On récupère le numéro de semaine dans le nom du fichier
	$semaine = intval(substr($_FICHIERS[$i], -6, 2);

	// On compare la semaine avec la fonction date(W) qui renvoie le numéro de semaine en cours
	if($semaine == date(W))
	{
		echo "<a href='Repertoire_source/".$_FICHIERS[$i]."'>".$_FICHIERS[$i]."</a>";

		// Inutile d'aller plus loin si le fichier est trouvé, on stoppe la boucle
		break;
	}
}

?>

<?php

$_FICHIERS = scandir("./Repertoire_source");
for($i=0 ; $i<=sizeof($_FICHIERS) ; $i++)
{
	// Définition de la date d'aujourd'hui
	$aujourdhui = date("Y-m-d");

	// On récupère la date dans le titre du fichier (d'abord année, puis mois, puis jour)
	$date = substr($_FICHIERS[$i], -14, 4)."-".substr($_FICHIERS[$i], -9, 2)."-".substr($_FICHIERS[$i], -6, 2);

	// On compare la date, et on affiche si c'est bon
	if($date <= $aujourdhui) echo "<a href='Repertoire_source/".$_FICHIERS[$i]."'>".$_FICHIERS[$i]."</li>";
}

?>

Eh bien par exemple, imaginons que tes noms de fichiers soient stockés dans une base de données, avec une date à partir de la laquelle ils seront disponibles en téléchargement (au format AAAA-MM-JJ). Quand l'utilisateur arrive sur la page, le code suivant pourrait fonctionner :

<?php

// Définition de la date d'aujourd'hui
$aujourdhui = date('Y-m-d');

// Récupération des fichiers disponibles au téléchargement
// (si leur date est en dessous ou égale à celle d'aujourd'hui)
$result = mysqli_query($db, "SELECT * FROM table_des_fichiers WHERE date<='".$aujourdhui."'");
while($row = mysqli_fetch_array($result))
{
          echo "<a href='Repertoire/".$row['nom_du_fichier']."'>".$row['nom_du_fichier']."</a>";
}

?>

Bon évidemment, c'est basique, faudrait quelques vérifications de sécurité pour éviter que n'importe qui télécharge n'importe quel fichier sans que ce soit autorisé, mais sur le principe ça évite un CRON.