Un article intéressant de nos collègues de Développez.com
Guide de style pour bien coder en PHP
Vous y trouverez des conseils pour nommer vos variables, indenter votre code, rédiger des commentaires.

A noter, le seul framework qui propose des conventions de nommage complètes est le framework Zend : conventions de nommage du Zend Framework. Elles ont l'avantage d'être compatibles PEAR et plutôt bien pensées. Si vous en connaissez d'autres, je suis preneur.