La seule façon pour ton site de contrôler et de lancer des processus sur une machine client, c'est utiliser les composants ActiveX sous Internet Explorer en javascript, après avoir réussi à les mettre en marche et avoir appris à les utiliser.
Voilà, maintenant tu sais que c'est possible, mais ça ne t'avance à rien.
A moins de vouloir passer par chaque poste client après chaque mise à jour de windows, et à constamment résoudre les différents conflits.