Ben oui!

C'est bien plus simple.

mais non tu t'embetes

$dna = array_count_values($codons);
foreach($dna as $key => $val)
{
    echo sprintf("J'ai %d codons GTT codant pour la %s <br />\n", $val, $key);
}

Si je comprends bien, tu n'as pas besoin de couper en séquences de trois caractères avant de commencer le traitement. Chaque caractère se trouve donc présent dans 3 codons comme ceci, le caractère 3 se trouve dans les codons, 123, 234 et 345.

Si tel est le cas et que tu doives coder une boucle "for", c'est simple
Il ne te reste alors qu'à organiser la présentation de tes résultats.

si mais c'est après ca, la on va avoir juste le tableau avec le nombre acide aminé
après tu fais une boucle sur ton tableau pour faire ta liste

EDIT oublie le str_split (je pensais que tu rentrais une sequence dans un textarea)

Avec une boucle for c pas possible? le prof veut que j'utilise une boucle for avecun tableau indicé et un tableau de frequence de chaque codon...
lol

hello,
avec array_count_values après avoir scindé ta chaine toutes les 3 lettres avec str_split

Bonjour,je vous explique mon problème, je suis en train d'essayer de faire un analyseur de séquence d'ADN.Pour cela j'ai créer un formulaire banal avec un textarea, ou je vais rentrer une séquence composée de ATGC, comme par exemple au hazard ATGCTGACTGCCCCTA...J'ai creer un tableau indicé contenant pour chaque codon le nom de leur acidé aminé correspondant, sachant que chaque plusieurs codons peuvent avoir le meme nom d'acide aminé. Voici mon tableau indicé :

$codons=array('GCA' => 'Alanine',
'GCC' => 'Alanine',
'GCT' => 'Alanine',
'CGA' => 'Arginine',
'CGC' => 'Arginine',
'CGG' => 'Arginine',
'CGT' => 'Arginine',
'AGA' => 'Arginine',
'AGG' => 'Arginine',
'GAC' => 'Acide aspartique',
'GAT' => 'Acide aspartique',
'AAC' => 'Asparagine',
'AAT' => 'Asparagine',
'TGC' => 'Cysteine',
'TGT' => 'Cysteine',
'GAA' => 'Acide glutamique',
'GAG' => 'Acide glutamique',
'CAA' => 'Glutamine',
'CAG' => 'Glutamine',
'GGA' => 'Glycine',
'GGC' => 'Glycine',
'GGG' => 'Glycine',
'GGT' => 'Glycine',
'CAC' => 'Histidine',
'CAT' => 'Histidine',
'ATA' => 'Isoleucine',
'ATC' => 'Isoleucine',
'ATT' => 'Isoleucine',
'CTA' => 'Leucine',
'CTC' => 'Leucine',
'CTG' => 'Leucine',
'CTT' => 'Leucine',
'TTA' => 'Leucine',
'TTG' => 'Leucine',
'AAA' => 'Lysine',
'AAG' => 'Lysine',
'ATG' => 'Methionine',
'TTC' => 'Phenylalanine',
'TTT' => 'Phenylalanine',
'CCA' => 'Proline',
'CCC' => 'Proline',
'CCG' => 'Proline',
'CCT' => 'Proline',
'TCA' => 'Sérine',
'TCC' => 'Sérine',
'TCG' => 'Sérine',
'TCT' => 'Sérine',
'AGC' => 'Sérine',
'AGT' => 'Sérine',
'ACT' => 'Thréonine',
'ACC' => 'Thréonine',
'ACG' => 'Thréonine',
'ACT' => 'Thréonine',
'TGG' => 'Tryptophane',
'TAC' => 'Tyrosine',
'TAT' => 'Tyrosine',
'GTA' => 'Valine',
'GTC' => 'Valine',
'GTG' => 'Valine',
'GTT' => 'Valine',
'TAG' => 'STOP',
'TAA' => 'STOP',
'TGA' => 'STOP');

Au final,quand je rentre ma sequence dans mon formulaire et que je valide,jaimerai avoir un resultat m'indiquant combien j'ai de chaque codon ATG par exemple ainsi que tout les autres codons contenu dans ma sequence que j'ai rentrer dans le formulaire.

ex:

J'ai 3 codons GTT codant pour la valine
J'ai 6 codons TGA codant pour le STOP
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Merci beaucoup